ProgrammeProgramme de la journée [Auditorium et hall - batiment IMAG] 8h45 - 9h15 : Accueil - café [Hall] 9h15 - 10h15 : Session "Evolution de Gricad et des services associés" [Auditorium]
10h15 - 10h45 : Pause - café [Hall] 10h45 - 12h00 : Session "Projets en cours" [Auditorium]
Résumé : Dans cet exposé j'expliquerai ce qui est compris dans le calcul des "facteurs d'impact" de quelques services numériques et je montrerai les limites de cette méthodologie (empreinte carbone) dans une perspective de mise en place d'une politique de sobriété numérique. Je finirai par une présentation du nouveau service de GRICAD : "Accompagnement à la mesure de l'empreinte du numérique et la mise en oeuvre d'une politique de sobriété numérique à l'échelle de votre projet ou de votre laboratoire.
12h00 - 13h30 : ----------- Déjeûner [Hall] --------------- 13h30 - 16h30 :Session "Panorama des usages de Gricad" [Auditorium]
Résumé : “Exploration of the adaptive immune repertoire is of paramount impact in both disease states and in vaccination settings. Understanding how B cells evolve to produce ever-matured antibodies thus enhancing protection against a variety of microbial threats could help us unlock the potential of both passive immunotherapies using monoclonal antibodies as well as better vaccines for improved immunizations. In the present work, we have probed the immune repertoire of an HIV infected donor to isolate broadly neutralizing antibodies (bNABs) that are able to block the infection from a variety of HIV strains.”
Résumé : La tomographie par rayons X est une technique de plus en plus utilisée dans de nombreux domaines de recherche (matériaux, santé, environnement, procédé, paléontologie …). Cette méthode permet d’imager de manière non destructive les matériaux à différentes échelles. De nombreux algorithmes utilisant l’intelligence artificielle sont développés et commencent à être utilisés par la communauté. Nous avons voulu mettre à disposition trois algorithmes prometteurs à la communauté grâce à une aide du GDR IAMAT et les implémenter sur GRICAD. Nous présenterons ici l’intérêt de tels algorithmes et quelques exemples d’application.
Résumé : Le laboratoire de recherche GIPSA-lab utilise la plateforme de virtualisation WINTER de GRICAD pour développer certains de ses projets de recherche, pour organiser les données et les métadonnées selon les principes FAIR, réaliser des analyses et produire des résultats utilisés par les chercheurs (publications et thèses). Dans le domaine de la santé, le projet PIVVIT étudie un Protocole de rééducation par Immersion Visuelle Virtuelle Interactive et Thérapeutique pour des patients atteints de lésion de l'oreille interne. Dans le domaine linguistique (SHS), le projet G-ULSID regroupe 31 lexiques qui permet l'étude de la phonétique des langues dans le monde. Dans le domaine du traitement de l'image, le projet Photo-Compare produit une enquête sur le réalisme d'images de synthèse. Avec ces trois exemples, cette présentation expliquera l'importance de l'organisation des données et leurs accès pour standardiser les traitements, permettre aux chercheurs d'utiliser les outils qu'il souhaite (Matlab, Python...), donner des exemples de réalisation (reconstitution de séance, analyses standardisées des données). Enfin cette présentation se terminera par un descriptif succinct du projet TransAPHO, qui utilise les données de recherche G-ULSID, stockées sur la machine virtuelle Winter Gricad, dans un but pédagogique. 15h30 - 16h00 : Pause - café [Hall]
Résumé : Les centres à deux cuivres sont des systèmes essentiels en chimie, étant naturellement présents dans certaines enzymes et participant à la catalyse de plusieurs réactions telle que l’activation de liaison C-H. Pour cette raison, ce type de système sert souvent de modèle pour le design de complexes dans des approches de chimie bio-inspirée. Pour complémenter les études expérimentales et de mieux comprendre les propriétés et les mécanismes de réaction, une étude théorique est souvent nécessaire. Néanmoins, la taille de ces systèmes ainsi que le couplage entre les deux cuivres nécessitent une description précise de la structure électronique ainsi que des méthodes appropriées, souvent couteuses en temps de calcul. Le but de cette étude est donc de trouver une méthodologie adaptée pour décrire les centres à deux cuivres, à la fois à l’échelle d’une enzyme et de plus petits complexes.
17h15 - Conclusion - Glenn Cougoulat / Pierre-Antoine Bouttier - Gricad.
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